Во второй половине 80-х годов по контракту министерства обороны Великобритании фирма «Бритиш аэроспейс» разработала на базе Sea Harrier FRS.1 усовершенствованный вариант Sea Harrier FRS.2, имеющий удлиненный на 0,35 м фюзеляж и увеличенный на 0,6 м размах крыла. Новая РЛС «Блю Виксен» позволяет применять американские УР AIM-120 класса «воздух—воздух» и осуществлять эффективную борьбу с воздушными целями в нижней полусфере. Более совершенное РЭО обеспечивает также использование противорадиолокационной УР (ПРУР) АЛАРМ и другого перспективного управляемого и обычного оружия. Боевые радиусы действия Sea Harrier FRS.2: 185 км — при вылете на патрулирование (время нахождения на рубеже 1,5 ч) с четырьмя ракетами AIM-120 и двумя подвесными баками по 860 л; 215 км — при перехвате воздушной цели, летящей со скоростью М = 0,9, без предварительного целеуказания или 175 км — для цели, летящей со скоростью М = 1,3; до 425 км — при наличии предварительного целеуказания (во всех случаях перехват выполняется с двумя УР AIM-120 без подвесных баков); 370 км — при действиях против кораблей с двумя ПКР «Си Игл» и двумя 30-мм пушками (профиль полета переменный); 970 км — при вылете на разведку на малой высоте (возвращение — на средних и больших высотах) с двумя подвесными баками по 860 л (вооружение — две 30-мм пушки, разведывательное оборудование — АФА F.95 для боковой съемки). В первой половине 90-х годов все построенные самолеты Sea Harrier FRS.1 планировалось модернизировать в Sea Harrier FRS.2. В дальнейшем предполагалось создать более современную модель (FRS.3).